Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms