Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnnt3Q9QZ47 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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