Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Kcnip3Q9QXT8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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