Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Limd1Q9QXD8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Limd1Q9QXD8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Limd1Q9QXD8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Limd1Q9QXD8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Limd1Q9QXD8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Limd1Q9QXD8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Limd1Q9QXD8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Limd1Q9QXD8 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Limd1Q9QXD8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Limd1Q9QXD8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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