Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdcQ9QW08 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms