Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tcea2Q9QVN7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tcea2Q9QVN7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tcea2Q9QVN7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tcea2Q9QVN7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tcea2Q9QVN7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tcea2Q9QVN7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tcea2Q9QVN7 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tcea2Q9QVN7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tcea2Q9QVN7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Tcea2Q9QVN7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tcea2Q9QVN7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms