Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pkd2l2Q9JLG4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms