Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tlr5Q9JLF7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tlr5Q9JLF7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tlr5Q9JLF7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tlr5Q9JLF7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tlr5Q9JLF7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tlr5Q9JLF7 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Tlr5Q9JLF7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Tlr5Q9JLF7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tlr5Q9JLF7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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