Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
CubnQ9JLB4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms