Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Hmgn5Q9JL35 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Hmgn5Q9JL35 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Hmgn5Q9JL35 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Hmgn5Q9JL35 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Hmgn5Q9JL35 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Hmgn5Q9JL35 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Hmgn5Q9JL35 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Hmgn5Q9JL35 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hmgn5Q9JL35 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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