Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Trem1Q9JKE2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms