Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Scamp5Q9JKD3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Scamp5Q9JKD3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms