Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rb1cc1Q9ESK9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms