Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
OtofQ9ESF1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
OtofQ9ESF1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms