Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ush1cQ9ES64 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms