Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp29Q9ES63 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp29Q9ES63 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms