Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Wdr61Q9ERF3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms