Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Tnfrsf23Q9ER63 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms