Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SgshQ9EQ08 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms