Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Med6-205ENSMUST00000161598 897 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm6586-201ENSMUST00000167028 643 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm45889-201ENSMUST00000209535 1057 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm44792-201ENSMUST00000207008 1628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm8321-201ENSMUST00000181691 980 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Tmem89-201ENSMUST00000026744 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Riok3Q9DBU3 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms