Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9S1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9S1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9D9S1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9D9S1 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms