Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chmp4cQ9D7F7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Chmp4cQ9D7F7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms