Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D727 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D727 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D727 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D727 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D727 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D727 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D727 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D727 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D727 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D727 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D727 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D727 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D727 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D727 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D727 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D727 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Q9D727 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Q9D727 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D727 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D727 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D727 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D727 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D727 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D727 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D727 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Q9D727 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms