Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tubgcp4Q9D4F8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms