Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q9D2Q3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q9D2Q3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms