Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Snapc3Q9D2C9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms