Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Mrpl53Q9D1H8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms