Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TbcbQ9D1E6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TbcbQ9D1E6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms