Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Syf2Q9D198 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Syf2Q9D198 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms