Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rrs1Q9CYH6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rrs1Q9CYH6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms