Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Prkrip1Q9CWV6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms