Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Khdc3Q9CWU5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Khdc3Q9CWU5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms