Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Pfdn1Q9CWM4 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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