Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BccipQ9CWI3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms