Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MINDY3Q9CV28 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MINDY3Q9CV28 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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