Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Fcf1Q9CTH6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Fcf1Q9CTH6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms