Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snw1Q9CSN1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snw1Q9CSN1 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms