Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ifitm3Q9CQW9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ifitm3Q9CQW9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ifitm3Q9CQW9 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ifitm3Q9CQW9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ifitm3Q9CQW9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ifitm3Q9CQW9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ifitm3Q9CQW9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ifitm3Q9CQW9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ifitm3Q9CQW9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Ifitm3Q9CQW9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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