Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Sec61bQ9CQS8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Sec61bQ9CQS8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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