Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Mrpl35Q9CQL6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Mrpl35Q9CQL6 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Mrpl35Q9CQL6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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