Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK1

Znhit3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znhit3Q9CQK1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Znhit3Q9CQK1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Znhit3Q9CQK1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms