Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufb9Q9CQJ8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms