Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl11Q9CQF0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl11Q9CQF0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms