Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rab5aQ9CQD1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms