Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Chmp3Q9CQ10 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms