Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NsmfQ99NF2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NsmfQ99NF2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms