Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Mrpl27Q99N92 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Mrpl27Q99N92 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Mrpl27Q99N92 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Mrpl27Q99N92 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Mrpl27Q99N92 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Mrpl27Q99N92 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Mrpl27Q99N92 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Mrpl27Q99N92 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Mrpl27Q99N92 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Mrpl27Q99N92 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
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