Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tlr3Q99MB1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tlr3Q99MB1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms