Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hps4Q99KG7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hps4Q99KG7 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms