Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Higd1bQ99JY6 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms